1. 前端预处理（物理过滤）
这是第一步，目的是去除水中的大颗粒悬浮物、杂质、浮沫等。
机械过滤器：
滚筒微滤机：非常高效和常见的设备，通过旋转的不锈钢筛网过滤水体，能去除60-200微米的颗粒。自动化程度高，需定期冲洗。
砂缸过滤器：利用石英砂作为滤料，进行深层过滤，精度较高。常用于中小型养殖场或育苗场。
自动反冲洗过滤器：当滤网堵塞到一定程度后，能自动进行反向冲洗排污，省去人工清洗的麻烦。
蛋白分离器（泡沫分离器）：主要应用于海水养殖和高密度循环水养殖（RAS）。通过产生大量微气泡，将水中的蛋白质、油脂等有机废物吸附并分离出去，能有效减少水体耗氧物。

2. 核心生化处理（生物过滤）
这是净水的核心环节，目的是降解水中剧毒的氨氮和亚硝酸盐。
生物滤池/生物转盘/流化床：这些是生化过滤的载体设备。其内部填充（或表面附着）生物填料（如生化球、细菌屋、Kaldnes填料等），为硝化细菌和反硝化细菌提供巨大的附着表面积。
硝化作用：将氨氮(NH₃/NH₄⁺) → 亚硝酸盐(NO₂⁻) → 硝酸盐(NO₃⁻)。
反硝化作用（高级系统配备）：将硝酸盐(NO₃⁻) → 氮气(N₂)逸出，彻底脱氮。

3. 深度处理与消毒杀菌（病原控制）
杀灭水中的细菌、病毒、寄生虫等病原体，防止疾病爆发。
紫外线消毒器（UV）：最常用、最安全的方法。水流经过UV灯管，紫外线能破坏微生物的DNA，使其无法繁殖。效果好，无化学残留。缺点是无持续杀菌能力，需定期更换灯管。
臭氧发生器（O₃）：强氧化剂，杀菌、消毒、脱色、除味效果极佳。但设备成本高，操作复杂，过量臭氧对养殖生物有毒，必须配备残余臭氧去除装置。
化学投药系统：如精确投加二氧化氯、次氯酸钠等消毒剂，需严格控制剂量。

4. 增氧与温控（环境优化）
增氧设备：如罗茨风机、漩涡风机通过底部的纳米曝气管或曝气盘向水中高效溶氧。液氧是大型高密度养殖场的首选，纯氧溶解效率极高。
温控设备：如热泵、锅炉（加热）和冷却塔（降温），用于维持水体最适生长温度。

5. 脱气与调质（可选，用于高端RAS系统）
二氧化碳脱气塔：去除水中过量的CO₂，有利于稳定pH值。
pH调节系统：自动监测并投加酸或碱，维持水体酸碱度稳定。